Développer une procédure et des outils pour la détermination des sources de contamination fécale de l’eau à l’aide de marqueurs génétiques

Description

La contamination de l’environnement par des matières fécales représente un risque potentiel pour la santé publique et contribue à l’augmentation des coûts de traitement de l’eau. Bien que certains indices peuvent permettre de cibler l’origine potentielle de cette contamination, il est généralement difficile de la déterminer avec certitude et cela conduit à des difficultés dans la mise en place de stratégies visant l’amélioration de la qualité de l’eau. Ce projet vise à développer une procédure qui permettra d’identifier les espèces animales à l’origine de la contamination fécale à l’aide de marqueurs génétiques. Elle tiendra compte des sources humaines et animales (élevages, faune) de contamination.

Objectif(s)

• Réaliser une revue de littérature sur les marqueurs génétiques permettant de cibler une contamination fécale universelle et de diverses espèces animales.
• Déterminer les limites de détection et de quantification des marqueurs ciblés.
• Documenter l’effet des conditions d’entreposage des fumiers/lisiers sur les marqueurs.
• Mesurer les contributions relatives des marqueurs dans l’eau en conditions contrôlées.
• Caractériser la persistance des marqueurs dans l’environnement.
• Valider la méthode en conditions réelles d’utilisation à l’échelle du bassin versant.